影片讲述了赖瑞经过第一集的博物馆奇遇后，以自己名字为品牌的手电筒赚了不少钱，衣食无忧，但心底总是有一点失落感，同时博物馆发生了一件大事，促使赖瑞再次回到了博物馆，继续奇妙之旅
那艾和南丹还有爷爷生活在乡下，明恩老师和剧团在安帕瓦的河边，两家本来都是孔剧世家，但是因为之前明恩老师的女儿美芬和那艾恋爱后死了，警察证据显示是那艾杀的，所以两家关系一直很尴尬，维音本名阿莫是个卧底警
在人类不知也无法到达的地方存在着一个妖怪世界。在朋友的保护和照顾下，鬼太郎在那个神秘的妖怪世界里开心快乐、自由自在的生活着。突然有一天，鬼太郎接到了妖怪信使带来的一封信，向他求助的是一个叫做三浦健太的
